鼓勵企業開展仿制藥質量和療效一致性評價工作。凡通過國家一致性評價的藥品（不同規格視為一個品種），每個品種給予100萬元的一次性獎勵；其中開展臨床有效性試驗的，每個品種給予200萬元的一次性獎勵。

企業新藥研發新進入臨床Ⅱ期、Ⅲ期研究的項目，分別給予100萬元、200萬元的獎勵。獲得國家新藥注冊證書并在本市產業化的，一類新藥每個品種給予1000萬元的獎勵，二類和三類新藥每個品種給予500萬元的獎勵。通過美國FDA制劑認證并在杭州市產業化的，每個品種給予100萬元的獎勵。